#!/bin/bash ######################################################################## # SUN Grid Engine job wrapper # parallel job on opteron queue ######################################################################## #$ -N wienkernel #$ -pe mpi 8 ##$ -q wsp64 #$ -q wp8 #$ -j y #$ -m e #$ -v LD_LIBRARY_PATH ######################################################################## # DON'T remove the following line! source $TMPDIR/sge_init.sh ######################################################################## #export PATH=/opt/mpich2-gnu/bin:$PATH #source /etc/profile.d/mklvarsem32t.sh #source /etc/profile.d/mklvarsem64t.sh #source /etc/profile.d/ifortvars.sh #gunzip WAVECAR.gz gunzip FeSb2.pmat.gz #ln -s FeSb2.pmatup FeSb2.pmat #ln -s FeSb2.energyup FeSb2.energy #ln -s FeSb2.weightup FeSb2.weight /opt/mpich-1.2.6-intel/bin/mpirun -np $NSLOTS -machinefile $TMPDIR/machines \ ./wienkernel >out.wienkernel rm *pmat* rm *weight* rm *energy* rm wienkernel #using different directory/version #/opt/mpich/bin/mpirun -np $NSLOTS -machinefile $TMPDIR/machines \ # ./your_parallel_executable command_line < input > output etc....