#!/bin/bash ######################################################################## # SUN Grid Engine job wrapper # parallel job on opteron queue ######################################################################## #$ -N wienkernel #$ -pe mpi 5 ##$ -q wsp64 #$ -q wp6 #$ -j y #$ -m e #$ -v LD_LIBRARY_PATH ######################################################################## # DON'T remove the following line! source $TMPDIR/sge_init.sh ######################################################################## #export PATH=/opt/mpich2-gnu/bin:$PATH #source /etc/profile.d/mklvarsem32t.sh #source /etc/profile.d/mklvarsem64t.sh #source /etc/profile.d/ifortvars.sh #gunzip WAVECAR.gz rm FeAs2.pmat.gz gunzip FeAs2.pmat_shift.gz ln -s FeAs2.pmat_shift FeAs2.pmat rm FeAs2.energy ln -s FeAs2.energy_shift FeAs2.energy rm FeAs2.weight ln -s FeAs2.weight_shift FeAs2.weight #rm inp.ef #ln -s inp.ef_0.2 inp.ef cp -f inp.opticS inp.optic /opt/mpich-1.2.6-intel/bin/mpirun -np $NSLOTS -machinefile $TMPDIR/machines \ ./wienkernel >out.wienkernel rm *pmat* rm *weight* rm wienkernel rm FeAs2.energy rm *energy* #using different directory/version #/opt/mpich/bin/mpirun -np $NSLOTS -machinefile $TMPDIR/machines \ # ./your_parallel_executable command_line < input > output etc....